La coloration mucicarmine est destinée à la coloration de la mucine. La mucine est une sécrétion produite par une variété de cellules épithéliales et de cellules du tissu conjonctif. Lors de certaines inflammations ou certains carcinomes intestinaux, un excès de mucine est sécrété par les cellules épithéliales.

La technique de coloration mucicarmine est également utile pour déterminer le site d'une tumeur primaire en permettant de visualiser les cellules tumorales produisant de la mucine dans une zone ne contenant pas de cellules productrices de mucine, ce qui signifie que la tumeur n'est pas apparue dans cette zone.

La coloration mucicarmine est également utile pour la coloration des champignons encapsulés comme cryptococcus.

Le principe de la coloration mucicarmine repose sur la présence d'aluminium qui forme un complexe de chélation avec la carmine. Cela change la charge de la molécule de carmine vers une charge positive ce qui lui permet de se lier aux substrats acides de faibles densités comme les mucines.