Le gène MALT1 (MALT1 paracaspase, alias MLT) code pour une paracaspase humaine et est souvent réarrangé dans les lymphomes MALT qui représentent 5 à 10 % de tous les lymphomes non hodgkiniens (LNH) à cellules B. Les translocations les plus fréquentes affectant le gène MALT1 sont t(11;18)(q22.2;q21.3) et t(14;18)(q32.3;q21.3) dans 50% et 15-20% des lymphomes MALT, respectivement. Ces translocations conduisent à l'expression des protéines de fusion BIRC3-MALT1 (API2- MALT1) et IGH-MALT1, entraînant une activation constitutive de la voie de signalisation NF-κB qui contrôle l'expression de nombreux gènes anti-apoptotiques et proliférants. La translocation t(11;18)(q22.2;q21.3) se trouve principalement dans les lymphomes pulmonaires et gastriques, tandis que t(14;18) (q32.3;q21.3) est plus fréquente dans les lymphomes MALT non gastro-intestinaux, par exemple, de la peau et des glandes salivaires. La présence d'un t(11;18)(q22.2;q21.3) est en corrélation avec l'absence de réponse à l'éradication d'Helicobacter pylori dans les lymphomes gastriques MALT. Par conséquent, la détection des translocations de MALT1 par hybridation in situ par fluorescence (FISH) peut être un outil de soutien pour identifier les patients admissibles à un traitement anti-H. pylori.