Les kits d’extraction de chromatine offrent des protocoles optimisés permettant d’isoler une chromatine intacte, incluant la chromatine associée aux noyaux, les fragments de chromatine solubles et les complexes protéiques liés à la chromatine, à partir de cellules en culture, d’échantillons primaires ou de tissus. Ces kits sont conçus pour préserver les interactions naturelles entre protéines et ADN ainsi que l’architecture de la chromatine, tout en éliminant les contaminants cytoplasmiques, ce qui les rend adaptés à un large éventail d’applications en épigénétique et en biologie de la chromatine.

La chromatine extraite peut être utilisée dans des protocoles tels que la digestion à la MNase, l’immunoprécipitation de chromatine (ChIP), les technologies CUT&Tag, CUT&RUN, l’ATAC-seq, la protéomique associée à la chromatine, ainsi que dans diverses analyses biochimiques et fonctionnelles.

Principaux avantages

• Isolement doux et reproductible : Des tampons et protocoles optimisés minimisent la perturbation de la chromatine tout en préservant les interactions protéines–ADN et l’organisation native de la chromatine.
• Formats de préparation flexibles : Adaptés à l’extraction de chromatine native, à la préparation de chromatine réticulée (crosslinkée) ou à l’isolement exclusif des noyaux selon les besoins expérimentaux.
• Large compatibilité avec les échantillons : Compatibles avec les lignées cellulaires en culture, les cellules primaires, les populations cellulaires triées, les tissus frais, les échantillons congelés et les spécimens à faible quantité de matériel biologique.
• Réduction du temps de manipulation : Des formulations standardisées de réactifs et des protocoles simplifiés améliorent la reproductibilité et réduisent la variabilité expérimentale.
• Préparations prêtes pour les analyses en aval : Les extraits de chromatine sont optimisés pour les applications de digestion enzymatique, d’immunoprécipitation, de tagmentation, de séquençage et de spectrométrie de masse.

Applications

• Préparation de noyaux et de chromatine native pour les protocoles de digestion à la MNase, ChIP, CUT&Tag, CUT&RUN et ATAC-seq.
• Extraction de chromatine réticulée pour les études d’immunoprécipitation de chromatine basées sur la fixation au formaldéhyde.
• Enrichissement des complexes protéiques associés à la chromatine pour les analyses protéomiques et la spectrométrie de masse.
• Applications à faible quantité d’échantillon impliquant des spécimens cliniques rares, des populations cellulaires triées ou des échantillons biologiques précieux.
• Préparation d’échantillons pour les études de remodelage de la chromatine, les essais d’activité enzymatique, la cartographie des nucléosomes et les expériences d’empreinte génomique (DNA footprinting).