Chromosomenzählsonden sind für die Identifizierung und Zählung menschlicher Chromosomen bestimmt in Interphase-Zellen und als Ergänzung zur Standard-Karyotypisierung in Metaphasen. Diese Sonden erzeugen scharfe, helle Signale, die für jedes einzelne Chromosom spezifisch sind.

Da mehrere Chromosomen dieselben repetitiven Sequenzen aufweisen, die zu Kreuzhybridisierungssignalen führen, können sie nicht durch zentromerspezifische Sonden unterschieden werden. Stattdessen können diese Chromosomen durch direkt markierte spezifische Sonden identifiziert werden, die in unmittelbarer Nähe zu den jeweiligen Satelliten-DNA-Sequenzen oder zu anderen chromosomenspezifischen Loci hybridisieren.

Die 1p12-Sonde ist so konzipiert, dass sie in unmittelbarer Nähe des Zentromers 1 bei 1p12, das WARS2 und HA02 beherbergt, hybridisiert. Da die Chromosomen 1, 5 und 19 dieselben repetitiven Sequenzen aufweisen, können sie mit Sonden, die zentromerspezifische Wiederholungen nachweisen, nicht unterschieden werden.