Chromosomenzählsonden sind für die Identifizierung und Zählung menschlicher Chromosomen bestimmt in Interphase-Zellen und als Ergänzung zur Standard-Karyotypisierung in Metaphasen. Diese Sonden erzeugen scharfe, helle Signale, die für jedes einzelne Chromosom spezifisch sind.

Da mehrere Chromosomen dieselben repetitiven Sequenzen aufweisen, die zu Kreuzhybridisierungssignalen führen, können sie nicht durch zentromerspezifische Sonden unterschieden werden. Stattdessen können diese Chromosomen durch direkt markierte spezifische Sonden identifiziert werden, die in unmittelbarer Nähe zu den jeweiligen Satelliten-DNA-Sequenzen oder zu anderen chromosomenspezifischen Loci hybridisieren.

Die 4p11-Sonde ist so konzipiert, dass sie in unmittelbarer Nähe des Zentromers 4 bei 4p11 hybridisiert, wo sich das ZAR1-Gen (Zygotenstillstand 1) befindet. ZAR1 ist ein eizellenspezifisches Gen, das am Übergang von der Eizelle zur Gamete zu wirken scheint. Für eine eindeutige Aufzählung von Chromosom 4 ist das SPEC 4p11 besser geeignet.