LymphoSign: CE/IVD-Kit zur Klassifizierung von Non-Hodgkin-Lymphomen
Non-Hodgkin-Lymphom ist eine Art von Krebs, die im lymphatischen System entsteht, das Teil des Immunsystems ist. Es ist durch das abnormale Wachstum von Lymphozyten, einer Art weißer Blutkörperchen, gekennzeichnet und kann in jedem Teil des Körpers auftreten.
Es gibt mehr als 80 Typen von Non-Hodgkin-Lymphomen, von denen einige selten und schwer zu charakterisieren sind. Genaues Wissen ist zu einem Schlüsselfaktor geworden.
Seit der Einführung der WHO-Klassifikation im Jahr 2001 wurden viele Fortschritte erzielt. Dennoch bleibt das Risiko von Fehlern höher als bei anderen Pathologien.
Der LymphoSign-Test bietet eine detaillierte Klassifikation dieser Lymphome. Es handelt sich um eine hochmoderne Methode zur Bewertung des Differenzierungsstadiums in Tumorzellen des Non-Hodgkin-Lymphoms (NHL). Durch die Nutzung von RNA-Expressionsniveaus von über 130 relevanten Genmarkern liefert diese Lösung wertvolle Einblicke in den Krankheitsverlauf.
Untertypen des Non-Hodgkin-Lymphoms
Hochgradiges B-Zell-Non-Hodgkin-Lymphom
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
Niedriggradiges B-Zell-Non-Hodgkin-Lymphom
- Follikuläres Lymphom (FL)
- Mantle-Zell-Lymphom (MCL)
- Marginalzonen-Lymphom (MZL)
- Kleinzelliges lymphozytäres Lymphom (SLL)
T-Zell-Non-Hodgkin-Lymphom
- Angioimmunoblastisches T-Zell-Lymphom (AITL)
- ALK-positives anaplastisches Großzelliges Lymphom (ALCL ALK+)
- ALK-negatives anaplastisches Großzelliges zytotoxisches Lymphom (ALCL ALK- cytotox)
- ALK-negatives anaplastisches Großzelliges Th2-Lymphom (ALCL ALK- Th2)
- Erwachsenes T-Zell-Leukämie-Lymphom (ATLL)
- NK/T-Zell-Lymphom (NKTCL)
Testmerkmale
LymphoSign ist ein innovativer, genauer und zuverlässiger Test für Pathologen und Molekularbiologen. Dieser Test wird verwendet, um Non-Hodgkin-Lymphome (NHL) zu charakterisieren.
Er bewertet den Differenzierungsgrad der Tumorzellen durch Analyse des Expressionsniveaus von mehr als 130 relevanten genetischen Markern, basierend auf der ligationsabhängigen PCR-Technologie (RT-MLPSeq).
Die Einfachheit des Tests ermöglicht es, Ergebnisse innerhalb von 24 Stunden aus Tumor-RNA zu erhalten. Das Protokoll ist für niedrigqualitative Proben wie FFPE-Proben optimiert.
Unter Verwendung von künstlicher Intelligenz, die auf einer Datenbank mit mehr als 3.000 Fällen trainiert wurde, etabliert die RT-MIS-Plattform die wahrscheinlichste Klassifikation unter 13 Subtypen von B-Zell- und T-Zell-NHL.
Was ist RT-MLPSeq?Wichtige Protokollmerkmale
Probenvorbereitung
- Keine Reinigung erforderlich bis zur Bibliotheksvorbereitung, was Materialverlust minimiert und hohe Sensitivität aufrechterhält.
- Kurze genetische Sequenzen (40-60 Basen) gezielt, was Robustheit gegen RNA-Abbau gewährleistet.
- Besonders geeignet für die Analyse schwieriger biologischer Proben wie paraffinfixierter Gewebebiopsien.
Sequenzierung
- 10⁵ Sequenzen pro Probe ausreichend für analysierbare Expressionsprofile, was Hochdurchsatz-Analyse ermöglicht.
- Bibliotheken können gleichzeitig mit anderen Sequenzierbibliotheken geladen werden, was die Kosteneffizienz optimiert.
Analyse
- Einmal die Sequenzierung abgeschlossen, kann die FASTQ-Datei auf die RT-MIS-Plattform hochgeladen werden.
- Nach wenigen Minuten Analyse wird ein Bericht mit der Expressionssignatur verschiedener Gene und einer KI-vorhergesagten Klassifikation gemäß der WHO-Klassifikation 2017 bereitgestellt.
Technische Spezifikationen
| Handhabungsdauer | ≃4 Stunden |
|---|---|
| Tatsächliche Arbeitszeit | ≃1 bis 1,5 Stunden |
| Art der Nukleinsäure | RNA |
| Eingangsmenge | Zwischen 50 und 500 ng RNA in einem Volumen von 2 µl |
| Art des Krebses | Non-Hodgkin-Lymphom |
| Inhalt des Reagenz-Kits | Proben, die 137 Marker targetieren, Barcodes, Sequenzprimer |
| Methode | Ligationsabhängige RT-PCR |
| Beschreibung | Vergleichen Sie die erhaltenen Expressionsprofile aus Genen, somatischen Mutationen oder chromosomalen Translokationen mit denen der Haupttypen von Non-Hodgkin-Lymphomen. |
| Gerätekompatibilität | MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina® |
| Art der Proben | Gewebebiopsien bei Raumtemperatur, gefroren oder fixiert und in Paraffin eingebettet |
| Technologie | Next-Generation-Sequenzierung |
Wichtige Merkmale und Vorteile
Verfügbare Kits
Ressourcen
Publikationen
-
High PDL1/PDL2 gene expression correlates with worse outcome in primary mediastinal large B-cell lymphoma
Vincent Camus et al., Blood Advances, December 12, 2023
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Integrative diagnosis of primary cutaneous large B-cell lymphomas supports the relevance of cell of origin profiling
Audrey Gros et al., PLoS One, April 22, 2022
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Circulating tumor DNA in primary mediastinal large B-cell lymphoma versus classical Hodgkin lymphoma
Vincent Camus et al., Leukemia & Lymphoma, April 2022
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Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
Fanny Drieux et al., Haematologica, June 2020
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Combining gene expression profiling and machine learning to diagnose B-cell non-Hodgkin lymphoma
Victor Bobée et al., Blood Cancer Journal, May 22, 2020
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