Il colorante blu di alcian viene utilizzato per colorare il muco acido e le mucine acetiche.

Nel mesotelioma si osservano quantità eccessive di muco acido non solforato. Questo muco è presente in quantità normali nelle pareti dei vasi sanguigni, ma aumenta nelle lesioni precoci dell'aterosclerosi.

Il pH della soluzione di colorazione al blu di Alcian è molto importante e ha un effetto diretto sulla categoria di mucine rivelate da questo metodo. Il pH della soluzione di colorazione di blu di Alcian può essere compreso tra 0,4 e 2,5.

Se il pH della soluzione è 1,0, la soluzione colorerà le mucine acide solfatate. Queste mucine si trovano principalmente nella cartilagine, nelle cellule a calice dell'intestino crasso e nella sierosa bronchiale.
Se la soluzione colorante di blu di Alcian ha un pH di 2,5, si colorano le mucine carbossilate dei tessuti connettivi e della cartilagine.