LymphoTranscript per l'individuazione di oltre 50 trascritti di fusione

La genetica del linfoma a cellule T periferiche (PTCL) è complessa e comprende numerosi trascritti di fusione ricorrenti identificati negli ultimi anni mediante sequenziamento ad alto rendimento. Nonostante questi progressi, non è ancora disponibile un metodo economico e rapido per la loro rilevazione simultanea in campioni clinici.

LymphoTranscript consente di rilevare i trascritti di fusione associati ai linfomi a cellule T periferiche in un unico test. Si tratta di un saggio economicamente vantaggioso.

Il saggio utilizza un metodo di RT-PCR dipendente da ligazione (LD-RT-PCR), una tecnica semiquantitativa che consente l'analisi simultanea di traslocazioni cromosomiche e mutazioni somatiche. Questo risultato è ottenuto mediante l'uso di coppie di sonde oligonucleotidiche progettate specificamente per mirare a ciascun marcatore.

Un protocollo semplice e rapido 

Il test in vitro prevede quattro passaggi, con una durata complessiva di circa mezza giornata, inclusi da 1 a 1,5 ore di tempo di manipolazione.

Il sequenziamento NGS richiede solo 100.000 letture per campione.

Inoltre, il test LymphoTranscript può essere sequenziato insieme ad altre librerie, grazie ai codici a barre forniti nel kit.

Analisi successiva al sequenziamento 

Dopo il sequenziamento, la piattaforma di analisi online RT-MIS facilita l'analisi automatizzata dei file FASTQ. Genera quindi un elenco delle fusioni rilevate nel campione biologico, insieme ai relativi dati quantitativi. RT-MIS fornisce anche la bibliografia di riferimento per queste fusioni.

Pertanto, RT-MIS offre agli utenti una soluzione semplice, rapida e sicura.

Caratteristiche di LymphoTranscript 

 
Ambito di applicazione Rilevamento di trascritti di fusione
Durata della manipolazione ≃4 ore prima del sequenziamento
Tipo di campioni Biopsie tissutali fresche, congelate o fissate e incluse in paraffina
Quantità di input Tra 50 e 500 ng in un volume di 2μL
Contenuto del kit di reagenti Sonde mirate a trascritti di fusione, mutazioni somatiche e virus HTLV1, codici a barre, primer di sequenziamento

 

Dettagli del prodotto 

 

N. cat. Descrizione Cond.
GEP-LT08 Kit LymphoTranscript  8 reazioni 
GEP-LT16 Kit LymphoTranscript 16 reazioni 
GEP-LT24 Kit LymphoTranscript  24 reazioni