La myogénine appartient à une famille de facteurs de transcription myogéniques, notamment MyoD, myf5 et MRF4, qui sont essentiels au développement musculaire. Les facteurs myogéniques sont des facteurs de transcription constitués d'une région riche en acides aminés et d'une structure hélice-boucle-hélice (HLH pour helix-loop-helix), qui peuvent favoriser le développement musculaire et maintenir l'expression génique spécifique au muscle par transactivation. La myogénine joue un rôle clé dans la détermination de l'engagement et de la différenciation des cellules mésenchymateuses primitives dans le muscle squelettique. La myogénine se trouve strictement dans les cellules d'origine des muscles squelettiques et est donc utilisée comme biomarqueur pour les tumeurs de la lignée musculaire, y compris les rhabdomyosarcomes alvéolaires. Une coloration à l'aide d'anticorps anti-myogénine peut se produire dans la tumeur de Wilms et mettre en évidence les noyaux des myoblastes dans le tissu musculaire en développement. La myogénine est également exprimée dans certains léiomyosarcomes.