Het BRAF-gen codeert voor een eiwit-serine/threoninekinase dat deelneemt aan de MAPK-cascade, die een groot aantal celprocessen regelt.

Diverse BRAF-translocaties werden waargenomen in melanocytaire nevi, pilocytaire astrocytomen, kwaadaardig melanoom, prostaat- en maagkanker. De AKAP9-BRAF-fusie als gevolg van paracentrische inversie van chromosoom 7q werd aangetroffen in door straling veroorzaakte papillaire schildkliercarcinomen.

De fusie-eiwitten bevatten het eiwitkinasedomein, maar missen het auto-inhibitoire N-terminale gedeelte van BRAF, wat resulteert in constitutieve kinase-activiteit.

Bovendien is bij pilocytisch astrocytoom de fusie FAM131B-BRAF beschreven, die het gevolg is van een interstitiële deletie waardoor het N-terminale inhibitorische domein van BRAF wordt verwijderd.