LymphoSign: CE/IVD-kit voor de classificatie van non-Hodgkin-lymfomen
Non-Hodgkin-lymfoom is een type kanker dat ontstaat in het lymfestelsel, dat deel uitmaakt van het immuunsysteem. Het wordt gekenmerkt door abnormale groei van lymfocyten, een type witte bloedcellen, en kan overal in het lichaam voorkomen.
Er zijn meer dan 80 typen non-Hodgkin-lymfoom, waarvan sommige zeldzaam en moeilijk te karakteriseren zijn. Nauwkeurige kennis is een sleutelvraag geworden.
Sinds de introductie van de WHO-classificatie in 2001 zijn veel vooruitgang geboekt. Het risico op fouten blijft echter hoger dan bij andere pathologieën.
De LymphoSign-test biedt een gedetailleerde classificatie van deze lymfomen. Het is een state-of-the-art methode voor het evalueren van het differentiatieniveau in non-Hodgkin-lymfoom (NHL) tumorcellen. Door gebruik te maken van RNA-expressieniveaus van meer dan 130 relevante genmarkers, biedt deze oplossing waardevolle inzichten in de ziekteprogressie.
Subtypen van non-Hodgkin-lymfoom
Hooggradig B-cel non-Hodgkin-lymfoom
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
Laaggradig B-cel non-Hodgkin-lymfoom
- Folliculair lymfoom (FL)
- Mantle-cel lymfoom (MCL)
- Marginaalzone-lymfoom (MZL)
- Klein lymfatisch lymfoom (SLL)
T-cel non-Hodgkin-lymfoom
- Angio-immunoblastisch T-cel lymfoom (AITL)
- ALK-positief anaplastisch grootcellig lymfoom (ALCL ALK+)
- ALK-negatief anaplastisch grootcellig cytotoxisch lymfoom (ALCL ALK- cytotox)
- ALK-negatief anaplastisch grootcellig Th2-lymfoom (ALCL ALK- Th2)
- Volwassen T-cel leukemie-lymfoom (ATLL)
- NK/T-cel lymfoom (NKTCL)
Testkenmerken
LymphoSign is een innovatieve, nauwkeurige en betrouwbare test voor pathologen en moleculaire biologen. Deze test wordt gebruikt om non-Hodgkin-lymfomen (NHL) te karakteriseren.
Het beoordeelt het differentiatieniveau van tumorcellen door het analyseren van het expressieniveau van meer dan 130 relevante genetische markers, gebaseerd op ligatie-afhankelijke PCR-technologie (RT-MLPSeq).
De eenvoud van de test maakt het mogelijk om resultaten binnen 24 uur te verkrijgen uit tumor-RNA. Het protocol is geoptimaliseerd voor monsters van lage kwaliteit zoals FFPE-monsters.
Met behulp van kunstmatige intelligentie getraind op een database met meer dan 3.000 gevallen, stelt het RT-MIS-platform de meest waarschijnlijke classificatie vast onder 13 subtypen van B-cel en T-cel NHL.
Wat is RT-MLPSeq?Belangrijkste protocolkenmerken
Monstervoorbereiding
- Geen zuivering vereist tot bibliotheekvoorbereiding, wat materiaalsverlies minimaliseert en hoge gevoeligheid behoudt.
- Korte genetische sequenties gericht (40-60 basen), wat robuustheid tegen RNA-afbraak garandeert.
- Bijzonder geschikt voor het analyseren van moeilijke biologische monsters zoals paraffine-vaste weefselbiopsieën.
Sequencering
- 10⁵ sequenties per monster voldoende voor analyseerbare expressieprofielen, wat hoge-doorvoeranalyse mogelijk maakt.
- Bibliotheken kunnen tegelijkertijd met andere sequenceringbibliotheken worden geladen, wat de kosten-efficiëntie optimaliseert.
Analyse
- Zodra de sequencering is voltooid, kan het FASTQ-bestand worden geüpload naar het RT-MIS-platform.
- Na enkele minuten analyse wordt een rapport geleverd met de expressiesignatuur van verschillende genen en een door AI voorspelde classificatie volgens de WHO-classificatie 2017.
Technische specificaties
| Behandelingstijd | ≃4 uur |
|---|---|
| Werkelijke werktijd | ≃1 tot 1,5 uur |
| Type nucleïnezuur | RNA |
| Invoermengte | Tussen 50 en 500 ng RNA in een volume van 2 µl |
| Type kanker | Non-Hodgkin-lymfoom |
| Inhoud van het reagentenkit | Probes gericht op 137 markers, barcodes, sequentieprimers |
| Methode | Ligatie-afhankelijke RT-PCR |
| Beschrijving | Vergelijk de verkregen expressieprofielen uit genen, somatische mutaties of chromosomale translocaties met die van de belangrijkste typen non-Hodgkin-lymfoom. |
| Apparaatcompatibiliteit | MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina® |
| Type monsters | Weefselbiopsieën bij kamertemperatuur, ingevroren of gefixeerd en ingebed in paraffine |
| Technologie | Next Generation Sequencing |
Belangrijkste kenmerken en voordelen
Beschikbare kits
Bronnen
Publicaties
-
High PDL1/PDL2 gene expression correlates with worse outcome in primary mediastinal large B-cell lymphoma
Vincent Camus et al., Blood Advances, December 12, 2023
Het artikel lezen -
Integrative diagnosis of primary cutaneous large B-cell lymphomas supports the relevance of cell of origin profiling
Audrey Gros et al., PLoS One, April 22, 2022
Het artikel lezen -
Circulating tumor DNA in primary mediastinal large B-cell lymphoma versus classical Hodgkin lymphoma
Vincent Camus et al., Leukemia & Lymphoma, April 2022
Het artikel lezen -
Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
Fanny Drieux et al., Haematologica, June 2020
Het artikel lezen -
Combining gene expression profiling and machine learning to diagnose B-cell non-Hodgkin lymphoma
Victor Bobée et al., Blood Cancer Journal, May 22, 2020
Het artikel lezen -
LymphoSign Test-Kit
De publicatie downloaden
Trainingsvideo
Medisch hulpmiddelwaarschuwing
Deze producten zijn medische hulpmiddelen.
Volg alstublieft de instructies van de fabrikant.
