Sarcoom diagnose in één enkele reactie

 Sarcoom diagnose in één enkele reactie

  De SarcomaFusion-test detecteert fusietranscripten in sarcomen. Deze transcripten, die geassocieerd worden met specifieke subtypen en gerichte behandelingen, zijn cruciaal voor de patiëntenzorg. De test maakt gebruik van gepatenteerde ligatie-afhankelijke PCR-technologie, vereenvoudigt de diagnostiek en vergroot ons begrip van de biologie van sarcomen. Het snelle protocol en de robuustheid maken het een waardevol hulpmiddel in de oncologie.

 

 Sarcoom fusie test

Een unieke test, gebaseerd op een gepatenteerde ligatie-afhankelijke PCR-technologie

 

Fusietranscripties worden vaak waargenomen in ongeveer 1/3 van de weke delen tumoren en de wetenschappelijke literatuur beschrijft meer dan 140 verschillende fusies.

Deze fusies worden vaak geassocieerd met specifieke histologische subtypes en doelgerichte therapieën, waardoor ze uiterst nuttige moleculaire diagnostische markers zijn.

Nauwkeurige detectie van deze fusietranscripties is van vitaal belang voor een optimaal beheer van patiënten met sarcomen.

In deze context biedt de SarcomaFusion test, ontwikkeld door Genexpath, een kosteneffectieve en efficiënte oplossing voor het detecteren van de fusie transcripten die verantwoordelijk zijn voor deze sarcomen. Met behulp van deze benadering kunnen sarcoomspecifieke fusietranscripten worden gedetecteerd en beoordeeld in een enkele uitgebreide analyse, waardoor het diagnostische proces wordt vereenvoudigd en een beter begrip wordt verkregen van de moleculaire aard van sarcoomtumoren.

 

 

 

 
 

Gebruik van de test

 
De GENEXPATH SarcomaFusion-test is gebaseerd op een ligatie-afhankelijke RT-PCR-methode (LD-RTPCR). Deze semikwantitatieve techniek kan worden gebruikt om gelijktijdig de expressieniveaus van een groot aantal genetische markers en, meer specifiek voor deze test, chromosomale translocaties te bepalen met behulp van paren oligonucleotide probes die specifiek zijn voor elk van deze markers.
 

Een snel en eenvoudig protocol 

  • Uit een totaal RNA-extract zijn vier stappen voldoende om de bibliotheken te verkrijgen.
  • Een omgekeerde transcriptiestap.
  • Een oligonucleotide sonde hybridisatie stap.
  • Een ligatiestap.
  • Een PCR-amplificatiestap, gevolgd door sequentiebepaling van de bibliotheken.
  • Geen voorafgaande zuivering vereist, waardoor materiaalverlies beperkt blijft en een hoge gevoeligheid gegarandeerd wordt.
  • Probes die gericht zijn op korte genetische sequenties (40-60 basen) en robuust zijn tegen RNA-degradatie.
  • Geschikt voor moeilijke monsters zoals paraffine-ingebedde weefselbiopten.
  • Slechts ongeveer 105 sequenties nodig per monster om een analyseerbaar expressieprofiel te verkrijgen.
  • GENEXPATH SarcomaFusion-bibliotheken kunnen worden geladen met andere sequencingbibliotheken om de kosten te optimaliseren.

 

 

 

Nauwkeurige computeranalyse met speciale software

Zodra de sequencing is voltooid, kan het FASTQ-bestand worden geüpload naar het RT-MIS platform. In slechts enkele minuten van analyse genereert RT-MIS een bestand met de gedetecteerde fusietranscripten. RT-MIS levert ook een bibliografie die bij de gedetecteerde transcripten hoort en biedt kankeronderzoekers zo een complete oplossing.

 

Behandelingsduur 5hrs30’
Werkelijke werktijd 1hr-1hr30’
Type nucleïnezuur     RNA
Invoerhoeveelheid     Tussen 50 en 500ng RNA in een volume van 2μl
Type kanker Sarcoom
Inhoud van de reagenskit Probes gericht op meer dan 140 fusietranscripten, barcodes, sequentieprimers
Methode Ligatie-afhankelijke RT-PCR
Beschrijving Detecteert meer dan 140 transcripten van sarcoom-geassocieerde fusie in één enkele analyse.
Compatibiliteit van apparatuur MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina®.
Type monsters Weefselbiopten gefixeerd en opgenomen in paraffine
Technologie Sequencing van de volgende generatie

 

RT-MIS is daarom eenvoudig, snel en veilig voor de gebruiker.

 

Nu kun je de kit kopen die aan je behoeften voldoet en er zeker van zijn dat je in korte tijd de beste resultaten behaalt. 

 

Producten  Maat Kat#
SarcomaFusion

  Test 
8 reacties

GEP-SF8

 16 reacties

GEP-SF16 

 24 reacties

GEP-SF24 

48 reacties

GEP-SF48

 

 

Voor meer informatie:

 

Raadpleeg de publicatie  van referentie  SarcomaFusion kit