As amígdalas, conjuntos de órgãos linfóides orientados para o trato digestivo, são a primeira defesa do sistema imunológico contra patógenos estrangeiros e ajudam a prevenir infecções respiratórias e gastrointestinais. As amígdalas incluem a amígdala adenoide, duas amígdalas tubárias, duas amígdalas palatinas e as amígdalas linguais. As amígdalas possuem células especializadas na captura de antígenos em sua superfície, chamadas células M, que ajudam a absorver os antígenos produzidos pelos patógenos. Essas células M então alertam as células B e T subjacentes na amígdala sobre a presença de um patógeno e uma resposta imune é estimulada. Células endoteliais, células epiteliais e fibroblastos são componentes essenciais necessários para o funcionamento normal do sistema amigdaliano. Mudanças na proliferação e regulação celular dentro do sistema amigdaliano levam ao desenvolvimento de amigdalite e hiperplasia adenoamigdalar.