LymphoTranscript para a deteção de mais de 50 transcritos de fusão

A genética do linfoma de células T periféricas (PTCL) é complexa, envolvendo numerosos transcritos de fusão recorrentes identificados nos últimos anos através de sequenciação de alto rendimento. Apesar destes avanços, continua a não estar disponível um método acessível e rápido para a sua deteção simultânea em amostras clínicas.

O LymphoTranscript permite a deteção de transcritos de fusão associados a linfomas de células T periféricas num único teste. Trata-se de um ensaio económico.

O ensaio utiliza um método de RT-PCR dependente de ligação (LD-RT-PCR), uma técnica semiquantitativa que permite a análise simultânea de translocações cromossómicas e mutações somáticas. Isto é conseguido através da utilização de pares de sondas de oligonucleótidos desenhados especificamente para visar cada marcador.

Um protocolo simples e rápido 

O teste in vitro envolve quatro passos, com uma duração total de cerca de meio dia, incluindo 1 a 1,5 horas de tempo de manipulação.

A sequenciação NGS requer apenas 100.000 leituras por amostra.

Além disso, o teste LymphoTranscript pode ser sequenciado juntamente com outras bibliotecas, com códigos de barras fornecidos no kit.

Análise pós-sequenciação 

Após a sequenciação, a plataforma de análise online RT-MIS facilita a análise automatizada de ficheiros FASTQ. Em seguida, gera uma lista de fusões detetadas na amostra biológica, juntamente com os dados quantitativos correspondentes. O RT-MIS também fornece a bibliografia relevante para estas fusões.

Assim, o RT-MIS oferece uma solução simples, rápida e segura para os utilizadores.

Características do LymphoTranscript 

 
Domínio de aplicação Deteção de transcritos de fusão
Duração da manipulação ≃4h antes da sequenciação
Tipo de amostras Biopsias de tecidos frescas, congeladas ou fixadas e incluídas em parafina
Quantidade de entrada Entre 50 e 500ng num volume de 2μL
Conteúdo do kit de reagentes Sondas direcionadas a transcritos de fusão, mutações somáticas e vírus HTLV1, códigos de barras, primers de sequenciação

 

Detalhes do produto 

 

N.º de Cat. Descrição Cond.
GEP-LT08 Kit LymphoTranscript  8 reações 
GEP-LT16 Kit LymphoTranscript 16 reações 
GEP-LT24 Kit LymphoTranscript  24 reações