Il cDNA di topo (DNA complementare) è generato mediante trascrizione inversa dell’RNA ottenuto da tessuti, cellule o altri campioni biologici di Mus musculus. Fornisce una rappresentazione in DNA delle molecole di RNA presenti nella preparazione di RNA di partenza ed è ampiamente utilizzato per studiare l’espressione genica del topo, le sequenze dei trascritti, le isoforme dei trascritti e la funzione genica. I progetti su larga scala di cDNA a lunghezza intera di topo hanno rivelato un’ampia diversità di trascritti e pattern di espressione dipendenti dal tessuto e dallo stadio di sviluppo, stabilendo le collezioni di cDNA come risorse importanti per la ricerca sul trascrittoma e sulla genomica funzionale.

Caratteristiche principali

• Origine specifica di topo : Derivato da fonti di RNA di Mus musculus per studi molecolari specie-specifici.

• Rappresentazione dei trascritti : Rappresenta le molecole di RNA presenti nel materiale di origine e può includere trascritti codificanti, regioni non tradotte e isoforme di trascritti, a seconda della fonte di RNA e della preparazione del cDNA.

• Materiale in formato DNA : Il cDNA può essere amplificato, sequenziato, clonato o analizzato utilizzando metodi standard di biologia molecolare.

Usi abituali nella ricerca

• PCR e qPCR : Utilizzato come stampo per l’amplificazione e la quantificazione di trascritti specifici.

• Identificazione e sequenziamento dei trascritti : Supporta la caratterizzazione e l’analisi di sequenza dei trascritti espressi.

• Clonaggio genico e studi di espressione : Fornisce uno stampo di DNA per esperimenti di clonaggio e di espressione genica funzionale.

• Analisi delle isoforme di trascritti e dello splicing alternativo: Consente l’indagine sulle isoforme di trascritti e sui pattern di splicing alternativo.

• Ricerca sul trascrittoma e genomica funzionale : Librerie di cDNA opportunamente costruite e collezioni di cDNA a lunghezza intera supportano la caratterizzazione del trascrittoma, la scoperta di geni, l’annotazione del genoma e la genomica funzionale.