Il DNA genomico di ratto è DNA genomico purificato isolato da Rattus norvegicus, un modello sperimentale ampiamente utilizzato in genetica, fisiologia, farmacologia e ricerca biomedica. Le risorse genomiche di ratto hanno supportato indagini sulla variazione genetica, sui tratti quantitativi, sui loci associati a malattie e sulle relazioni genotipo-fenotipo tra i ceppi di laboratorio.

Il DNA genomico fornisce un modello per saggi molecolari mirati a regioni genomiche specifiche e per analisi su scala genomica. La sua idoneità per applicazioni a valle dipende dall’integrità, dalla concentrazione e dalla purezza del DNA, nonché dal background genetico o dal ceppo dell’animale, poiché la variazione di sequenza tra i ceppi di ratto può influenzare l’analisi e l’interpretazione del genotipo.

Caratteristiche principali

• Specie : DNA genomico di Rattus norvegicus.

• Modello genomico: DNA genomico nucleare contenente sequenze codificanti e non codificanti.

• Applicazioni di ricerca : PCR, genotipizzazione, analisi delle varianti, sequenziamento e altri flussi di lavoro genomici quando la qualità del DNA soddisfa i requisiti del saggio.

• Rilevanza del ceppo : Le varianti genetiche differiscono tra i ceppi e i sottotipi di ratto e possono essere rilevanti per studi comparativi e fenotipici.

Usi di ricerca abituali

• PCR e genotipizzazione : Rilevamento di alleli specifici o di modificazioni genetiche ingegnerizzate.

• Analisi di SNP e varianti : Caratterizzazione del background genetico e delle differenze tra ceppi.

• Sequenziamento del DNA e sequenziamento dell’intero genoma : Identificazione di varianti di sequenza e indagine sui determinanti genetici di tratti complessi.

• Mappatura genetica e genomica comparativa : Uso dei dati di genotipo per indagare regioni genomiche associate a fenotipi fisiologici o correlati a malattie.