LymphoSign: kit CE/IVD per la classificazione dei linfomi non Hodgkin
Il linfoma non Hodgkin è un tipo di cancro che origina nel sistema linfatico, che fa parte del sistema immunitario. È caratterizzato dalla crescita anomala di linfociti, un tipo di globuli bianchi, e può verificarsi in qualsiasi parte del corpo.
Esistono più di 80 tipi di linfoma non Hodgkin, alcuni dei quali sono rari e difficili da caratterizzare. La conoscenza accurata è diventata una questione chiave.
Molti progressi sono stati compiuti dall'introduzione della classificazione dell'OMS nel 2001. Tuttavia, il rischio di errori rimane più alto rispetto ad altre patologie.
Il test LymphoSign offre una classificazione dettagliata di questi linfomi. È un metodo all'avanguardia per valutare lo stadio di differenziazione nelle cellule tumorali del linfoma non Hodgkin (LNH). Sfruttando i livelli di espressione dell'RNA di oltre 130 marcatori genetici rilevanti, questa soluzione fornisce preziose informazioni sulla progressione della malattia.
Sottotipi di linfoma non Hodgkin
Linfoma non Hodgkin a cellule B ad alto grado
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
Linfoma non Hodgkin a cellule B a basso grado
- Linfoma follicolare (FL)
- Linfoma a cellule del mantello (MCL)
- Linfoma della zona marginale (MZL)
- Linfoma linfocitico piccolo (SLL)
Linfoma non Hodgkin a cellule T
- Linfoma T angioimmunoblastico (AITL)
- Linfoma anaplastico a grandi cellule ALK-positivo (ALCL ALK+)
- Linfoma anaplastico a grandi cellule ALK-negativo citotossico (ALCL ALK- cytotox)
- Linfoma anaplastico a grandi cellule ALK-negativo Th2 (ALCL ALK- Th2)
- Leucemia-linfoma a cellule T dell'adulto (ATLL)
- Linfoma NK/T-cell (NKTCL)
Caratteristiche del test
LymphoSign è un test innovativo, accurato e affidabile per patologi e biologi molecolari. Questo test viene utilizzato per caratterizzare i linfomi non Hodgkin (LNH).
Valuta il grado di differenziazione delle cellule tumorali analizzando il livello di espressione di oltre 130 marcatori genetici rilevanti, basato sulla tecnologia PCR dipendente dalla ligazione (RT-MLPSeq).
La semplicità del test consente di ottenere risultati entro 24 ore dall'RNA tumorale. Il protocollo è ottimizzato per campioni di bassa qualità come i campioni FFPE.
Utilizzando intelligenza artificiale addestrata su un database di oltre 3.000 casi, la piattaforma RT-MIS stabilisce la classificazione più probabile tra 13 sottotipi di LNH a cellule B e T.
Cos'è RT-MLPSeq?Caratteristiche principali del protocollo
Preparazione del campione
- Nessuna purificazione richiesta fino alla preparazione della libreria, minimizzando la perdita di materiale e mantenendo un'alta sensibilità.
- Sequenze genetiche brevi targettizzate (40-60 basi), garantendo robustezza contro la degradazione dell'RNA.
- Particolarmente adatto per l'analisi di campioni biologici difficili come biopsie di tessuto fissate in paraffina.
Sequenziamento
- 10⁵ sequenze per campione sufficienti per profili di espressione analizzabili, consentendo un'analisi ad alto throughput.
- Le librerie possono essere caricate simultaneamente con altre librerie di sequenziamento, ottimizzando l'efficienza dei costi.
Analisi
- Una volta completato il sequenziamento, il file FASTQ può essere caricato sulla piattaforma RT-MIS.
- Dopo pochi minuti di analisi, viene fornito un report con la firma di espressione di vari geni e una classificazione prevista dall'IA secondo la classificazione OMS 2017.
Specifiche tecniche
| Durata della manipolazione | ≃4 ore |
|---|---|
| Tempo di lavoro effettivo | ≃1 a 1,5 ore |
| Tipo di acido nucleico | RNA |
| Quantità di input | Tra 50 e 500 ng di RNA in un volume di 2 µl |
| Tipo di cancro | Linfoma non Hodgkin |
| Contenuto del kit di reagenti | Sonde che targettizzano 137 marcatori, codici a barre, primer di sequenza |
| Metodo | RT-PCR dipendente dalla ligazione |
| Descrizione | Confronta i profili di espressione ottenuti da geni, mutazioni somatiche o traslocazioni cromosomiche con quelli dei principali tipi di linfoma non Hodgkin. |
| Compatibilità attrezzature | MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina® |
| Tipo di campioni | Biopsie tissutali a temperatura ambiente, congelate o fissate e incluse in paraffina |
| Tecnologia | Sequenziamento di nuova generazione |
Caratteristiche e benefici principali
Kit disponibili
Risorse
Pubblicazioni
-
High PDL1/PDL2 gene expression correlates with worse outcome in primary mediastinal large B-cell lymphoma
Vincent Camus et al., Blood Advances, December 12, 2023
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Integrative diagnosis of primary cutaneous large B-cell lymphomas supports the relevance of cell of origin profiling
Audrey Gros et al., PLoS One, April 22, 2022
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Circulating tumor DNA in primary mediastinal large B-cell lymphoma versus classical Hodgkin lymphoma
Vincent Camus et al., Leukemia & Lymphoma, April 2022
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Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
Fanny Drieux et al., Haematologica, June 2020
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Combining gene expression profiling and machine learning to diagnose B-cell non-Hodgkin lymphoma
Victor Bobée et al., Blood Cancer Journal, May 22, 2020
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LymphoSign Test-Kit
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