Chromosoomtellingsprobes zijn ontworpen voor identificatie en telling van menselijke chromosomen in cellen in de interfase en als aanvulling op de standaard karyotypering in metafasen. Deze probes produceren scherpe, heldere signalen die specifiek zijn voor elk afzonderlijk chromosoom. 

Aangezien verschillende chromosomen dezelfde repetitieve sequenties delen, wat leidt tot kruishybridisatiesignalen, kunnen zij niet worden onderscheiden met centromeer-specifieke probes. In plaats daarvan kunnen deze chromosomen worden geïdentificeerd met direct gelabelde specifieke probes die in de nabijheid van de respectieve satelliet-DNA-sequenties of van andere chromosoomspecifieke loci hybridiseren.

De 21q22 sonde hybridiseert met de zogenaamde Down Syndrome Critical Region op 21q22.13-q22.2 die vaak dubbel voorkomt in gevallen met gedeeltelijke trisomie 21. Het gebied op 21q22 omvat de DSCR4 (Down syndrome critical region 4). Aangezien de chromosomen 13 en 21 dezelfde herhalende sequenties hebben, kunnen zij niet worden onderscheiden met probes die centromeer-specifieke herhalingen opsporen.