Het mesothelin-gen codeert een 69-kDa precursoreiwit dat wordt verwerkt tot een 40-kDa glycosylfosfatidylinositol (GPI)-geankerd eiwit, het volwassen mesothelin, dat aanwezig is op het celoppervlak. De biologische functie ervan is niet bekend, maar recente studies hebben aangetoond dat het een sterk en specifiek complex vormt met MUC16; een binding die de basis zou vormen voor metastasering van eierstokkanker. Mesothelin is aanwezig op normale mesotheliale cellen die het borstvlies, het buikvlies en het hartzakje bekleden. In tumoren is overexpressie van Mesothelin waargenomen in mesotheliomen en andere tumoren, waaronder ovarium- en pancreascarcinomen en cholangiocarcinomen. Door het gebruik van immunotoxine gerichte immunotherapie is mesotheline ook gemeld als een nieuw therapeutisch doelwit bij verschillende soorten kanker, zoals humaan cholangiocarcinoom.