LymphoTranscript para la detección de más de 50 transcritos de fusión

La genética del linfoma de células T periféricas (PTCL) es compleja e involucra numerosos transcritos de fusión recurrentes identificados en los últimos años mediante secuenciación de alto rendimiento. A pesar de estos avances, todavía no se dispone de un método rápido y asequible para su detección simultánea en muestras clínicas.

El LymphoTranscript permite la detección de transcritos de fusión asociados con linfomas de células T periféricas en una sola prueba. Es un ensayo rentable.

El ensayo utiliza un método de RT-PCR dependiente de ligación (LD-RT-PCR), una técnica semicuantitativa que permite el análisis simultáneo de translocaciones cromosómicas y mutaciones somáticas. Esto se logra mediante el uso de pares de sondas de oligonucleótidos diseñados específicamente para dirigirse a cada marcador.

Un protocolo simple y rápido 

La prueba in vitro consta de cuatro pasos, con una duración total de aproximadamente medio día, incluyendo de 1 a 1,5 horas de tiempo de manipulación.

La secuenciación NGS requiere solo 100 000 lecturas por muestra.

Además, la prueba LymphoTranscript se puede secuenciar junto con otras bibliotecas, con códigos de barras proporcionados en el kit.

Análisis posterior a la secuenciación 

Después de la secuenciación, la plataforma de análisis en línea RT-MIS facilita el análisis automatizado de archivos FASTQ. A continuación, genera una lista de las fusiones detectadas en la muestra biológica, junto con los datos cuantitativos correspondientes. RT-MIS también proporciona la bibliografía relevante para estas fusiones.

Por lo tanto, RT-MIS ofrece una solución simple, rápida y segura para los usuarios.

Características de LymphoTranscript 

 
Dominio de aplicación Detección de transcritos de fusión
Duración de la manipulación ≃4h antes de la secuenciación
Tipo de muestras Biopsias tisulares frescas, congeladas o fijadas e incluidas en parafina
Cantidad de entrada Entre 50 y 500ng en un volumen de 2μL
Contenido del kit de reactivos Sondas dirigidas a transcritos de fusión, mutaciones somáticas y virus HTLV1, códigos de barras, cebadores de secuenciación

 

Detalles del producto 

 

N.º de cat. Descripción Cond.
GEP-LT08 Kit LymphoTranscript  8 reacciones 
GEP-LT16 Kit LymphoTranscript 16 reacciones 
GEP-LT24 Kit LymphoTranscript  24 reacciones